이세계의균형이무너지고있다!방과후교실,유타는분명기억속에있을그리드맨을몇번이고노트에그렸다지운다.과거에이세계는한소녀에의해만들어지고붕괴되었으며그소녀의마음을구한자는다른차원에서온하이퍼에이전트그리드맨과그녀가만들어낸마음을가진괴수,그리고유타와그일행들이었다.고등학교2학년이되면서릿카와반이갈린유타는고백을결심한다.하지만이들의평화로운일상은굉음과함께무너지기시작한다.이윽고진홍의강룡다이나렉스와그리드맨의협력자인신세기의중학생,그리고다른세계의거주민,아사나카일행들도유타앞에차례차례모습을드러낸다.릿카를향한마음을숨긴채,유타의비일상이시작된다.