’2040년인류최초의이민행성에덴.7년전소꿉친구‘뮹’을두고서로를등지게된‘이사무’와‘걸드’는통합우주군의차세대주력가변전투기선정프로젝트를통해재회해각각YF-19와YF-21의테스트파일럿으로치열한경쟁을펼치게된다.한편,‘뮹’이프로듀스한버추얼아이돌‘샤론애플’은완벽한무대로모두의마음을사로잡으며마크로스시티를지배한다.하지만불완전한인공지능‘샤론애플’의음모로‘뮹’은목숨을위협받는위기에처하고,‘이사무’와‘걸드’는‘뮹’을구하기위해‘샤론애플’이조종하는최신예무인전투기에맞서는데…2023년11월,SF걸작애니메이션-‘마크로스’시리즈의진수가펼쳐진다!